¿Cuál es la diferencia entre en el coche y llevar el coche?

En el coche significa: en el coche

Coger el coche significa: dar un paseo

La única diferencia entre ambos es que uno está en el coche , uno fuera del coche.

Voy al colegio en el coche de mi padre

Traducción; Voy al colegio en el coche de mi padre

Llevo el coche al colegio

Traducción; voy a la escuela

En cuanto a cuándo usarlo, depende del significado de la pregunta. No te preocupes, el significado de la pregunta será muy claro.