¿Cuál es el valor Ct del resultado de la prueba de ácido nucleico del nuevo coronavirus?
Para popularizar mejor el conocimiento sobre la prevención y el control de infecciones hospitalarias y facilitar la comprensión e implementación de las medidas de prevención y control de epidemias, hoy lo ayudaremos a comprender cuál es el valor Ct de los resultados de la prueba de ácido nucleico. el nuevo coronavirus es.
Aprendizaje de hoy
Pregunte: ¿Cuál es el valor Ct del resultado de la prueba de ácido nucleico del nuevo coronavirus?
Respuesta: La detección del ácido nucleico del nuevo coronavirus suele utilizar el método de PCR (reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa, RT-PCR) de fluorescencia en tiempo real. Es posible que los valores de Ct no aparezcan en los resultados. El valor Ct (umbral de ciclo) se refiere al número de ciclos experimentados cuando la señal de fluorescencia en cada tubo de reacción alcanza el umbral de detección establecido. Los estudios han demostrado que existe una relación lineal entre el valor Ct de cada plantilla y el logaritmo del número de copia inicial de la plantilla (también conocido como "cantidad"). Cuanto mayor es el número de copia inicial, menor es el valor Ct; y viceversa.
——"Medical Molecular Biology" 2nd Edition, Jiangsu Phoenix Science and Technology Press, editado por Zhang Xiangyang, 2018
En la actualidad, la detección de ácido nucleico de la neumonía por el nuevo coronavirus se realiza principalmente se dirige al ácido nucleico en el genoma del nuevo coronavirus. Se detectaron el marco de lectura abierto 1ab (marco de lectura abierto 1ab, ORF1ab) y la proteína de la nucleocápside (proteína de la nucleocápside, N). Los resultados de las pruebas antes de la séptima edición del "Plan de control y prevención de la neumonía por nuevo coronavirus" fueron:
① Negativo: sin valor de Ct o Ct≥40.
② Positivo: Valor Ct <37, se puede reportar como positivo.
③ Área gris: el valor de Ct está entre 37 y 40. Se recomienda repetir el experimento. Si el valor de Ct es <40 y la curva de amplificación tiene un pico obvio, la muestra se considera positiva. , en caso contrario es negativo.
④ Nota: Si se utiliza un kit comercial, prevalecerán las instrucciones proporcionadas por el fabricante.
Cuando es positivo, cuanto menor es el valor de Ct significa mayor número de copias del ácido nucleico viral (que normalmente puede entenderse como mayor cantidad de virus), y también indica que el sujeto está más contagioso.
A medida que existen cada vez más tipos de kits de prueba comerciales, los límites de detección y los valores de la zona gris establecidos por cada uno pueden ser diferentes, por lo tanto, a partir de la octava edición del "Prevención y prevención de la neumonía por nuevo coronavirus". Plan de control", el juicio del resultado de la prueba se cambia a:
① Negativo: sin valor Ct ni curva de amplificación en forma de S.
②Positivo: el valor de Ct es menor o igual al límite de detección y hay una curva de amplificación en forma de S, que puede informarse como positiva.
③ Área gris: el valor de Ct está en el área gris. Se recomienda repetir el experimento. Si el valor de Ct todavía está en el área gris, pero aparece una curva de amplificación obvia en forma de S, el. La muestra se considera positiva; de lo contrario, es negativa.
④ Nota: Si se utiliza un kit comercial, prevalecerán las instrucciones proporcionadas por el fabricante.
——"Anexo 10 del Plan de control y prevención de la neumonía por nuevo coronavirus (octava edición) - Directrices técnicas para la recolección y detección de muestras de nuevo coronavirus"
El texto es demasiado largo y No quiero leerlo. Solo lea la versión de conclusión:
No importa cómo cambiemos, solo debemos recordar una cosa: cuanto menor sea el valor de CT, menor será el número de ciclos necesarios. para alcanzar el umbral establecido, lo que significa que mayor será la carga viral.
Por poner un ejemplo:
Si vemos informes como este:
Los valores de CT de los dos casos positivos anteriores en el cribado inicial Fueron 36, 18 y 39, 19 representan respectivamente el número de ciclos experimentados cuando la señal de fluorescencia alcanza el umbral establecido durante la detección del gen ORF1ab y del gen N del ácido nucleico del nuevo coronavirus. Cuanto menor es el valor de CT, mayor es la carga viral y. cuanto más fuerte es la transmisibilidad, por lo tanto, Shi Moumou del Caso 4 La carga detectada del nuevo coronavirus es mucho mayor que la de Gao en el Caso 3, y el Caso 4 es altamente transmisible.
Cabe señalar que un resultado negativo de la prueba de ácido nucleico para COVID-19 no puede descartar la infección por COVID-19. Es necesario descartar factores que puedan producir falsos negativos, entre ellos: mala calidad de la muestra, como por ejemplo. muestras respiratorias de la orofaringe y otras partes del cuerpo; recolección de muestras demasiado temprana o demasiado tardía; conservación, transporte y procesamiento incorrectos de las muestras por razones de la tecnología en sí, como mutación del virus, inhibición de la PCR, etc.