no importa y aunque

La diferencia es muy simple.

1 no importa pronombre interrogativo/adverbio interrogativo sujeto predicado verbo (otros componentes)

No importa lo que hagas, lo haré apoyarte.

No importa la edad que tengas, puedes seguir aprendiendo.

2 aunque oración (cláusula subordinada), oración (cláusula principal)

Aunque hoy está muy ocupado, vendrá a jugar al fútbol con nosotros.

Haré el trabajo por ti aunque no estoy del todo dispuesto a hacerlo.

Ella debería perdonarse a sí misma _NO IMPORTA___ lo horrible que pensó que había sido

== AUNQUE pensó que había sido muy horrible, debería perdonarse a sí misma.

== Ella debería perdonarse a sí misma AUNQUE ella pensó que había sido muy horrible.