Desarrollo tecnológico de secuenciación del genoma de alto rendimiento

Plataforma de secuenciación de alto rendimiento (high-throughput_genome_sequence_database) Desde que 454 Life Sciences (la empresa fue adquirida oficialmente por Roche en 2007) lanzó la plataforma de pirosecuenciación 454 FLX en 2005, Applied BioSystem (ABI), que ha lanzado El secuenciador de ADN 3730xl (Analizador de ADN 3730xl), siempre ha ocupado la mayor parte del mercado de secuenciación. Su posición de liderazgo ha comenzado a tambalearse, porque su producto estrella, la serie de secuenciadores de electroforesis de matriz capilar (máquinas de secuenciación de electroforesis de matriz capilar en serie) se ha encontrado con dos. fuertes competidores, uno es el secuenciador 454 de Roche (secuenciador Roch GS FLX), y el otro es la plataforma de análisis del genoma Solexa (Genome) lanzada por la empresa estadounidense Illumina en 2006. Plataforma analizadora), por esta razón, en 2007 ABI lanzó su propia Secuenciador SOLiD desarrollado (secuenciador ABI SOLiD). Estas tres plataformas de secuenciación son representantes de las plataformas de secuenciación de alto rendimiento actuales.

En los últimos años, la tecnología de secuenciación de alto rendimiento ha evolucionado desde métodos basados ​​en placas de gel (por ejemplo, "S Radiolabeled Sequencing Manual, ABl 373, ABIPRISM 377, Li-corIR2 DNA Sequencer) hasta secuenciadores capilares (como como los secuenciadores de ADN ABI Prism 3100, 3700 y 3730xl, Megabace1000 y Megabace 5000), se han publicado revisiones sobre métodos y equipos para preparar ADN y secuenciar (Meldrum, 2000a, b). El cambio a secuenciadores capilares ha resuelto el trazado de vías. Los problemas inherentes a la tecnología de placas de gel y la automatización de los secuenciadores capilares han aumentado significativamente el rendimiento al tiempo que proporcionan longitudes secuenciables más largas. Estos avances han aumentado significativamente la cantidad de patógenos humanos producidos en los últimos años. El equipo de secuenciación de última generación incluye 25 analizadores de ADN ABIPrism 3700, 24 analizadores de ADN AppliedBiosystems 3730xl y 6 analizadores de ADN ABIPrism 3100. Aproximadamente 50 proyectos están en marcha al mismo tiempo. Se realizaron más de 3.400.000 reacciones de secuenciación anualmente y se completaron 6.000.000 de reacciones. finales de 2002. La capacidad actual de secuenciación de TIGR es de 14.000.000 de secuenciaciones por año.