Las definiciones, diferencias, rutas y condiciones de configuración específicas de los métodos de un paso, dos pasos y tres pasos en la PCR ordinaria.

El método de un solo paso utiliza cebadores especiales y solo establece una temperatura durante todo el proceso para completar la amplificación. Esta imprimación especial está patentada.

El método de dos pasos consiste en configurar dos pasos en la amplificación cíclica. Este método amplifica principalmente fragmentos cortos. Uno es la desnaturalización a 95 grados y el otro es la temperatura de recocido y amplificación, que generalmente se establece entre 55 y 60 grados. Por supuesto, hay excepciones.

El método de tres pasos es un método comúnmente utilizado. El ciclo de amplificación tiene tres pasos: desnaturalización, hibridación y extensión.