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primer5.0 design primer: cómo usar PRIMER5.0 para diseñar cebadores

Utilice primerpremier5.0 para diseñar cebadores

Haga clic en el archivo, seleccione Nueva secuencia de ADN (Archivo——Nuevo——DNASeqence) y luego copie la secuencia con la que desea diseñar el cebador. en (si lo desea, puede escribir las bases una por una), luego haga clic en Cebador para ingresar a la interfaz de diseño del cebador. Después de ingresar, seleccione Buscar para establecer las condiciones correspondientes, como por ejemplo: ¿desea diseñar una amplificación por PCR? ¿O secuenciar cebadores, hacia adelante o hacia atrás? O bidireccional, diseñar la posición en el fragmento y la longitud del cebador, etc. Después de configurarlo, simplemente haga clic en Aceptar hasta el final y luego aparecerán los cebadores. elegir.

Jaja, pero los pasos específicos 1L parecen haberse dado en el sitio web, pero al diseñar cebadores, debes prestar atención a algunas condiciones, como el valor de TM y GC, así como la longitud del cebador. etc. ^_ ^

De todos modos, cuando diseño cebadores, normalmente controlo TM y GC entre 50-60, y la longitud suele ser de 18 o 19 bases (555 se carga por base cuando se sintetiza), no coinciden No hay horquillas ni horquillas, pero si hay dímeros de cebador, no es un gran problema (de todos modos, los cebadores que diseñé con dímeros están básicamente bien, entonces es mejor no tener 4 o más bases consecutivas, y luego ahí). No diseñe cebadores dentro de secuencias repetitivas.

Siempre que prestes atención a lo anterior, los cebadores diseñados estarán bien para secuenciar o amplificar.

Jaja, espero que sea útil para LZ Cómo usar PRIMER5. 0 para diseñar cebadores

Ingrese al software, archivo de ventana de genetank---nuevo----DNAsequence e ingrese a la sección de entrada de secuencia. Luego control+v ingresa a la secuencia. Si no desea cambiar la secuencia, seleccione el menú AS.

Luego ingresa al diseño de imprimación. Ingrese la búsqueda y haga clic en Aceptar. El sistema genera automáticamente cebadores.

Solo elige lo que necesitas. (con calificaciones). Si desea clonar un gen, diséñelo manualmente en el menú de cebador. Diseño de cebadores PrimerPremier5.0

1. Principios de diseño de cebadores de PCR

2. Pasos de diseño de cebadores del software PrimerPremier5.0

p>①Secuencia de entrada: después de instalar el software, primero abra el software y opere en la esquina superior izquierda, file-new-dnasequence Este elemento puede pegar la secuencia copiada en él, o puede elegir otro archivo-open-dnasequence para abrir. uno. nuevo archivo. ②Haga clic en Imprimación para ingresar a la interfaz de diseño de imprimación. ③Haga clic en el botón de búsqueda en la interfaz de diseño de la cartilla para configurar las opciones de búsqueda. ④Haga clic en el botón Aceptar en la interfaz de opciones de búsqueda para obtener los resultados del diseño del cebador. ⑤ Seleccione el par de cebadores con puntuación alta como opción de cebador de síntesis experimental. ⑥Edite los cebadores según sea necesario.