¿Qué son Q20 y Q30?

Al analizar datos de secuenciación de alto rendimiento, estaremos familiarizados con Q20/Q30. Entonces, ¿qué significa Q20/Q30? ¿Cómo surgió?

Q20 y Q30 representan el porcentaje de un determinado valor de calidad base con respecto al número total de bases, que es similar a la tasa de calificación del producto. Diferentes estándares de calidad producirán diferentes tasas de calificación. Cuanto mayor sea el estándar, mayor será la calidad. Cuanto mejor es la calidad, menos datos cumplen los estándares; cuanto mayor es la tasa de aprobación, más datos cumplen los estándares. En términos generales, cuando Q30>85, significa que la calidad de los datos está calificada. Otro es el contenido de GC, que generalmente está entre 50 y 60.

La puntuación de calidad de secuenciación Q de una base determinada se define como la siguiente ecuación:

La relación entre la puntuación de medición y la precisión de llamada de la base es la siguiente:

Bien, dejemos de hablar de esto en este número. Nos vemos en el próximo número.