El Ministerio de Ecología y Medio Ambiente tiene varios institutos ambientales directamente dependientes del Ministerio de Ecología y Medio Ambiente.

El Ministerio Nacional de Ecología y Medio Ambiente tiene dos institutos de ciencias ambientales directamente dependientes. Se trata del Instituto de Ciencias Ambientales de Nanjing de la Administración Estatal de Protección Ambiental, en lo sucesivo denominado Instituto de Ciencias Ambientales de Nanjing, ubicado en Nanjing, provincia de Jiangsu, y el Instituto de Ciencias Ambientales del Sur de China de la Administración Estatal de Protección Ambiental, en lo sucesivo denominado El Instituto de Ciencias Ambientales del Sur de China, ubicado en Guangzhou, provincia de Guangdong, cuando realiza trabajos de inspección de protección ambiental externamente, el Centro de Inspección de Protección Ambiental de China Oriental de la Administración Estatal de Protección Ambiental, en lo sucesivo denominado Centro de Inspección de Protección Ambiental de China Oriental, y el Sur. El Centro de Inspección de Protección Ambiental de China de la Administración Estatal de Protección Ambiental, en lo sucesivo denominado Centro de Inspección de Protección Ambiental del Sur de China, se utiliza respectivamente.